由於扁平疣沒有症狀，初期人們不會重視它的存在，只當它是個肉芽、贅肉之類無關痛癢的小東西，直到有一天小肉芽變大、變多了才會警覺去求醫診治。病毒感染與個人的抵抗力、免疫狀況習習相關；有的人絕少感染到扁平疣，有的人不但感染，並且是感染一大堆扁平疣，這種現象就是與每個人的抵抗力強弱、免疫狀況不同所致。搔抓也是造成扁平疣擴散的原因之一，身上長個小東西，一般人難免會去摳抓，有時我們會看到扁平疣成直線狀，連續好幾個排成一列，應當是與搔抓導致感染有關。

治療扁平疣有許多種方式，有的時候耐心等候，時間便是最好的醫師，但病患不見得能苦候兩、三年等扁平疣自然消失。扁平疣療法可以分為傳統療法與免疫療法；傳統療法大多以破壞扁平疣組織為主，舉例而言：化學藥物燒灼、電氣燒灼、冷凍治療、雷射治療、使用維生素 A 製劑局部塗抹等都是常用的方法；但疼痛、容易復發且在治療部位易留下疤痕或色素沉著則是上述療法不利之處。

於是乎提升個人免疫系統能力，讓扁平疣逐漸消失於無形的免疫療法亦有其一席之地；口服免疫調節藥物、外用免疫調節藥物、服用中藥以提高免疫系統能力等方法皆有人使用，並獲得相當不錯的療效。只是免疫療法需要較長的時間（數週到數月）才能看見效果，患者宜有耐心與醫師配合進行，無法一蹴可及。傳統療法也可以和免疫療法合併使用，複合療法來獲致更佳的成效。

因為病毒感染與個人的抵抗力、免疫狀況密切相關，日常生活中不乏簡易可行的保健強身之道，例如：飲食、營養均衡，勿偏食以攝取足夠養份，並以天然食品少添加物，少油少鹽多蔬果為佳；多到郊外接近大自然，呼吸新鮮空氣；適度運動改善身體體能；不熬夜、睡眠充足、適當休息使體內修補回復機制得以完全運作；戒菸、飲酒適度；保持愉快樂觀心情；以上雖近似老生常談，但都確有助於增強體能，提高免疫力的作用，縱使不能百毒不侵，多少也會減少疾病的發生及病毒的侵犯。